Arkeologlar Kaunos da yapılan kazılarda altı tapınak bulmuşlar. Bu tapınakların dördü Roma, ikisi Helenistik döneme ait. Kaunos ta bulunan bir yazıtta Apollon, Posedion, Artemis, ve Aphrodite adları geçiyor. Heredot a göre Kaunoslular yabancı tanrılarına değil kendi tanrılarına inanıyor.

Kaunos Antik şehrinde bulunan ve adi çeşitli kitaplarda Kubbeli Kilise olarak geçen yapı kentin en önemli noktasına, Roma Hamami ile tiyatro arasında kalan Palaestra düzlüğünün yaklaşık merkezine inşa edilmiştir. Türünün Anadolu daki en eski ve en iyi korunmuş örneklerinden biridir. Yaklaşık kare formundadır. 14x14.5 m ve üç gemilidir (Nef). Orta Nef kubbe, yan Nefler ise tonoz örtülüdür. Her biri ayrı Neflere açılan üç ayrı kabin ile girilir. Doğu yönde, her iki yanda ki küçük Sapeller, geç dönemde eklenmiştir. Birkaç kez onarılmış olan kilisenin ilk inşası, muhtemelen 5. yy nin sonları olmalıdır.