Arkeologlar Kaunos da yapilan kazilarda alti tapinak bulmuslar. Bu tapinaklarin dördü Roma, ikisi Helenistik döneme ait. Kaunos ta bulunan bir yazitta Apollon, Posedion, Artemis, ve Aphrodite adlari geçiyor. Heredot a göre Kaunoslular yabanci tanrilarina degil kendi tanrilarina inaniyor.

Kaunos Antik sehrinde bulunan ve adi çesitli kitaplarda Kubbeli Kilise olarak geçen yapi kentin en önemli noktasina, Roma Hamami ile tiyatro arasinda kalan Palaestra düzlügünün yaklasik merkezine insa edilmistir. Türünün Anadolu daki en eski ve en iyi korunmus örneklerinden biridir. Yaklasik kare formundadir. 14x14.5 m ve üç gemilidir (Nef). Orta Nef kubbe, yan Nefler ise tonoz örtülüdür. Her biri ayri Neflere açilan üç ayri kabin ile girilir. Dogu yönde, her iki yanda ki küçük Sapeller, geç dönemde eklenmistir. Birkaç kez onarilmis olan kilisenin ilk insasi, muhtemelen 5. yy nin sonlari olmalidir.