Die Archäologen haben bei den Ausgrabungen in Kaunos sechs Tempel entdeckt. Vier von diesen Tempeln stammen von der römischen Zeit und zwei von denen der hellenistischen Zeit ab. In einer Inschrift bei Kaunos werden die Namen Apollo, Poseidon, Artemis und Aphrodite erwähnt. Nach Heredot glaubt Kaunos nicht an fremde Götter sondern an seine eigenen.

Die Struktur, die sich in der antiken Kaunos Stadt befindet und deren Namen in verschiedenen Büchern als gewölbte Kirche erwähnt wird, wurde an der wichtigsten Stelle der Stadt, auf die Palasestra Ebene, die zwischen der Rom Hamami und dem Theater liegt, ungefähr in der Mitte gebaut. Es ist in seiner Art eines der ältesten und besten geschützten Exemplare in Anatolien. Sie ist ungefähr quadratförmig. Sie beträgt 14 x 14,5 und hat drei Schiffe ( Nef?? ). Das mittlere Schiff ist mit einer Wölbung und die neben Schiffe mit einem Wrapen bedeckt. In jedes Schiff kann man durch drei verschiedene Kabinen hineingehen, die sich zu den Schiffen öffnen. Die westliche Seite, wo sich an jeder Seite kleine Sapellen befinden, ist im spaeten Zeitabschnitt hinzugefügt worden. Der erste Bau der mehrmals renovierten Kirche lautet wohl vermutlich das Ende des 5 Jh.